Aéreas:
No se encuentran habilitadas.
Terrestres:
Chiquinquirá se encuentra en el centro de dos importantes ejes viales, el primero, que conecta a Santafé de Bogotá con Bucaramanga, de importancia nacional; y el segundo que conecta al occidente del Departamento con el centro y a través de él con todas las demás zonas de importancia regional. Lo anterior sumado a que gran parte de su desarrollo se ha debido justamente a esta condición de ciudad de paso.
Las vías Santafé de Bogotá – Bucaramanga y Tunja – Occidente de Boyacá son al mismo tiempo los principales ejes de conexión urbana - rurales del Municipio puesto que la vía a Santafé de Bogotá es al mismo tiempo la principal comunicación con el Corregimiento Mariscal Sucre (Veredas Sucre Oriental, Sucre Occidental y Tierra de Páez).
La vía a Bucaramanga es simultáneamente la que comunica con la Vereda Casa Blanca.
La vía a Tunja es también la vía principal del Corregimiento Comuneros, siendo especialmente importante para Balsa, Carapacho, Sasa y Moyavita y la vía a Occidente atraviesa la parte sur de la Vereda Resguardo.
Fluviales:
No son aptas para la navegación.